こんにちは。

＞つまりは特殊部隊員の格闘術は任務に応じた強さということでしょうか？例えば格闘家のような試合向けではなく、実戦的なものをやっているという理解で良いか？

その通りです。
SATやSSTの格闘術については、詳細不明ですが、様々な武道や格闘技から、任務に合った技を選択、改良したものではないかと推測されます。
こうした格闘術は、競技形式にして競技に勝つ事に特化するためのものでは無いので、想定動作や型が主な訓練ではないかと思います。

＞SAT隊長は突入したりしませんが、他の隊員と同様に格闘術はやっていますか

やっていなければ、隊員の行動や活動が理解できません。
推測ですが、SATの隊長は、警部補位の階級でSATの隊員(班長)を経験し、警視の階級に昇任した方々の中から任命されるのではないかと思います。